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illustration communiqué de presse. © Inra

Communiqués de presse

Sommaire
  1. Introduction
  2. TWB annonce un bilan positif et ambitionne de devenir le leader européen des biotechnologies industrielles
  3. "TWB START-UP DAY" : un vivier d’innovations biotechs
  4. Maïs OGM MON 810 et NK603 : pas d'effets détectés sur la santé et le métabolisme des rats
  5. Développer les légumineuses : un enjeu mondial pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement
  6. Nutrition animale : Adisseo et TWB confirment le succès de l’alternative biologique pour produire la méthionine
  7. TWB intègre deux nouvelles start-ups : iMEAN et Green Spot Technologies
  8. De nouvelles perspectives pour l’amélioration variétale du blé et sa culture : le séquençage du génome du blé est aujourd’hui réalisé
  9. Des observations satellites éclairent les secrets du verdissement des forêts tropicales sèches
  10. Mariner la viande rouge pour limiter le risque de cancer colorectal
  11. Numérique en productions végétales : prédire et agir
  12. Effet cocktail de pesticides à faible dose par l’alimentation : les premiers résultats chez l’animal montrent des perturbations métaboliques
  13. Le génome du chêne lève un voile sur la longévité des arbres
  14. Infections nosocomiales : la bactérie Bacillus cereus peut aussi en être la cause
  15. Au travers de TWB et TSE-R, l’Inra confirme son soutien au développement de la bioéconomie française
  16. Biologie des systèmes, biologie synthétique et bioéconomie : l’Inra, le CNRS et l’Insa Toulouse unissent leurs forces en Asie du Sud-Est
  17. Le génome de la rose décrypté : de l'origine des rosiers modernes aux caractéristiques de la fleur
  18. Mieux cibler l’aide alimentaire destinée aux personnes vulnérables
  19. ‘Hey, Start-me up !’ : retour sur les temps forts de l’événement dédié aux start-ups en biotech
  20. Les petites parcelles agricoles favorisent les pollinisateurs et le succès reproducteur des plantes en Europe de l’Ouest
  21. Création d’une unité Inra et ENVT, dédiée aux innovations thérapeutiques pour réduire l’usage des médicaments en élevage
  22. Les Cultures Intermédiaires Multi-Services au cœur de la transition agroécologique
  23. Pierre Monsan reçoit le PRIX ENZYME ENGINEERING
  24. Suite à son intégration dans le consortium de TWB, Heurisko met sa technologie de pointe au service de la R&D en biotechnologie
  25. Changer la représentation des élèves sur les métiers de la recherche grâce à un outil pédagogique innovant : la boîte à métiers !
  26. L’Inra condamne les agissements d’activistes sur son site d’Auzeville
  27. Le génome du tournesol révèle l'orchestration des gènes impliqués dans la production d'huile et la floraison
  28. MicroPep Technologies intègre Toulouse White Biotechnology pour accélérer le développement de biostimulants et d’herbicides naturels
  29. Microbiote et contaminants alimentaires : une mycotoxine amplifie l’action génotoxique d’une bactérie intestinale
  30. Toulouse White Biotechnology confirme son succès avec l’arrivée de nouveaux partenaires industriels et l’accueil de start-up
  31. Agri Sud-Ouest Innovation et l’Inra s’associent à la stratégie #FranceIA pour développer l’Intelligence Artificielle dans le secteur agricole
  32. Additif alimentaire E171 : les premiers résultats de l’exposition orale aux nanoparticules de dioxyde de titane
  33. Lancement du 1er dictionnaire scientifique d’agroécologie !
  34. Co-construire la recherche avec les Régions pour le développement durable des territoires
  35. TWB et AURIGA IV Bioseeds partenaires pour soutenir la création d’entreprises en biotechnologie industrielle
  36. Inauguration du LabCom VIRAL* dédié à la virologie aviaire et cunicole
  37. Le génome du tournesol décrypté
  38. TWB inaugure ses nouveaux locaux et équipements
  39. Projet Viola Tolosa
  40. Un séquenceur unique en France s’installe à l’Inra de Toulouse Midi-Pyrénées
  41. Diversifier les cultures et les variétés en associant  les nouvelles technologies : un dispositif original à l’INRA de Toulouse Midi-Pyrénées
  42. TWB et TOLERYS : Un partenariat public-privé réussi, au service de la santé
  43. La diversité des habitats non cultivés : un facteur clé pour préserver la biodiversité dans les exploitations agricoles
  44. Le génome du canard séquencé

Un séquenceur unique en France s’installe à l’Inra de Toulouse Midi-Pyrénées

Communiqué de presse - Accélérer l’identification de régions d’intérêt de plantes comme le tournesol ou de parasites comme l’Orobanche cumana1 pour mieux comprendre leurs mécanismes de résistance et d’attaque, nécessite l’acquisition d’un matériel de pointe. Impulsé par plusieurs équipes de recherche2 du centre Inra de Toulouse Midi-Pyrénées dans le cadre du Projet Investissement d’Avenir SUNRISE, soutenu par la Région Midi-Pyrénées et les partenaires industriels Sofiprotéol et Libragen, un séquenceur d’ADN longs fragments de toute dernière génération, le PacBio RS II, est aujourd’hui disponible au sein de la plateforme de génomique GeT-PlaGe de la Génopole de Toulouse.

Mis à jour le 17/03/2017
Publié le 04/11/2015
Mots-clés :

Grâce aux avancées technologiques de ces 20 dernières années, les laboratoires de recherche peuvent désormais acquérir l’information génétique ou génome3 de n’importe quel organisme. En fonction de sa complexité, il est plus ou moins facile de reconstituer et d’identifier le catalogue de gènes qui le constitue. Cette étape de décryptage est essentielle car la comparaison des catalogues de gènes d’organismes proches mais ayant des caractéristiques légèrement différentes est la stratégie-clé pour identifier les gènes responsables d’une propriété d’intérêt (comme la résistance à une maladie, la teneur en protéine ou la tolérance à la sécheresse).

Le PacBio RS II, séquenceur à haut débit de 3e génération permet d'obtenir dans des délais très courts (quelques jours contre plusieurs mois), des résultats d’une qualité inégalée sur le génome entier d’une espèce ainsi que sur des zones ciblées, ouvrant ainsi un champ nouveau d'applications pour l'activité de services génomiques dans les domaines de l’agronomie, l’écologie, la médecine…

Des infrastructures et une expertise de 1er rang en sciences du vivant et de l’information

L’Inra a investi fortement à Toulouse dans le développement des technologies pour l’acquisition à haut débit des données en génomique. Au sein de la plateforme technologique génomique GeT-PlaGe, qui met à disposition de la communauté scientifique une expertise et des outils innovants, le PacBio RS II vient renforcer cette infrastructure. Il va permettre de s’attaquer aux défis actuels et futurs pour aider à mieux comprendre le vivant.

Le décryptage d’un génome est une étape nécessitant la maîtrise d’outils et de méthodes informatiques ainsi que des moyens de calculs importants.

Près de 50 bio-informaticiens s’y attaquent au quotidien. Ils bénéficient de moyens de calculs et de stockage unique, dans un environnement sécurisé grâce au 1er Data Center de l’Inra sur le site d’Auzeville, inauguré en 2014 et financé à parité par l’Inra et la Région Midi-Pyrénées pour un total de près de 3 M €.

Une adaptation permanente des dispositifs et des compétences en faveur de l’innovation

L’ambition de l’Inra est de maintenir au meilleur rang les activités de recherche dans les laboratoires français, en disposant d'infrastructures à la pointe de la technologie, et ainsi garantir la qualité de l’implication des scientifiques dans de nombreux projets européens et internationaux.

Ouvert aux partenaires professionnels, ce nouvel équipement, le PacBio RS II, est également un atout en faveur de l’innovation. La technologie PacBio va permettre de finaliser dans les mois qui viennent le décryptage du génome de référence du Tournesol. Il sera une avancée majeure dans le développement de nouvelles variétés plus résistantes aux maladies et plus tolérantes à la sécheresse dans un contexte de changement climatique et il apportera une aide aux producteurs pour mieux lutter contre les parasites comme l’orobanche, par une utilisation encore plus raisonnée des intrants.

 

Le PacBio RS II a bénéficié d'un financement global (équipement et ressources humaines) d’un peu plus de 1,3 million d'euros dont 36 % financé par le FEDER, 36 % par la Région Midi-Pyrénées, 14,6 % par l'Inra, 13 % par Sofiprotéol et 0,4 % par Libragen.

 

Télécharger le communiqué de presse (pdf)

 

1Orobanchecumana : parasite se fixant sur les racines de tournesol, provoquant d'importants dégâts dans les pays producteurs. Sa présence est avérée en France et notamment dans la Région Midi-Pyrénées depuis 2009.
2Equipe Tournesol et Bioinformatique du LIPM, Laboratoire Interactions Plantes Microorganismes (Inra-CNRS), la plateforme de génomique GeT-Plage et le Centre National de Ressources Génomiques (CNRGV)
3Génome : ensemble du matériel génétique d’un organisme.

Projet Investissement d’Avenir SUNRISE

logos. © Inra
logos © Inra

A propos de

A propos de la Région Midi-Pyrénées

« Soutien aux plateformes  mutualisées de recherche, soutien aux allocations de recherche, appels à projets de recherche collaborative. Voici quelques-unes des nombreuses initiatives de  la Région pour conforter l’excellence de Midi-Pyrénées en matière de recherche et d’innovation. En 2015, la Région a consacré 48 M€ de crédits régionaux au soutien à la recherche ainsi que 6 M€ de fonds FEDER dont elle est gestionnaire des fonds pour la période 2014-2020.

Avec 10 000 chercheurs et 400 laboratoires publics, Midi-Pyrénées est la sixième région européenne pour l’effort de recherche avec 4.8% du PIB régional investi dans la R&D. »

A propos de Sofiprotéol

Société de financement et de développement, filiale du Groupe AVRIL, SOFIPROTEOL est un partenaire stratégique des acteurs de l’agro-industrie et de l’agroalimentaire. Dédiée principalement aux filières françaises des huiles et protéines, SOFIPROTEOL contribue à structurer et développer des filières nationales fortes et profondément ancrées dans les territoires, tant au travers de prises de participation ou prêts dans les entreprises sur fonds propres qu’au travers d’opérations de financement de l’innovation, sur fonds d’origine interprofessionnelle.

En effet,  depuis sa création, l’innovation est au cœur de son activité avec le soutien de programmes d’intérêt général destinés à assurer l’avenir de la filière des huiles et des protéines. Ces financements d’origine interprofessionnelle visent à inciter public et privé à améliorer la compétitivité de la production oléoprotéagineuse, favoriser l’innovation et les programmes de recherche appliqués et développer les perspectives offertes par les différents débouchés.

A propos de Libragen

Etablie en 2001 sur la base de ses technologies propriétaires en métagénomique, Libragen est une société de services R&D spécialisée notamment dans les études de métagénomique et de métatranscriptomique. Son expertise en matière d’échantillonnage et d’extraction de l’ADN et de l’ARN éprouvée sur des milieux parfois très complexes, ainsi que ses compétences en termes de clonage, de séquençage et d’analyse des données, ont permis à Libragen d’être au cœur de nombreux projets d’innovation. Ceux-ci ont par exemple permis l’analyse descriptive et comparative de l’évolution de microbiotes (intestinal, cutané) suite à l’introduction de molécules actives, ou bien encore d’identifier les gènes de nouvelles enzymes exploitées ensuite par Libragen sur ses plateformes de biocatalyse industrielle. L’utilisation de séquenceurs nouvelle génération plus puissants permettra à Libragen d’accélérer encore ses développements en accédant plus rapidement et plus fidèlement à l’information génétique.